Giai đoạn từ 1996-2006

Viện Khoa học và Công nghệ giao thông vận tải (Khoa học và công nghệ GTVT) - Thời kỳ dần bắt nhịp với nền kinh tế thị trường và hội nhập.

Sau gần 50 năm hoạt động và phát triển, đến nay Viện Khoa học và Công nghệ GTVT đã trở thành một trong các tổ chức nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ (R&D) với nhiều uy tín và thành tựu ở nước ta.
Chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Viện được quy định trong Quyết định số 2559/QĐ/BGTVT ngày 29/08/2004 của Bộ Giao thông vận tải. Viện đã có đăng ký hoạt động Khoa học và Công nghệ số 117 ngày 10/07/1993 do Bộ Khoa học - Công nghệ và Môi trường cấp, và số đăng ký A-065 ngày 18/03/2003 do Bộ Khoa học - Công nghệ cấp. Về Tài chính, Bộ Giao thông vận tải đã cho phép Viện được tự chủ kể từ 01/01/2003 theo Nghị định số 10/2002/NĐ-CP ngày 16/01/2002 của Chính phủ về chế độ tài chính áp dụng cho đơn vị sự nghiệp có thu. 
 
Hiện nay, Viện có cơ sở vật chất kỹ thuật như sau:
- Tổng mặt bằng: hơn 17.000 m2, ở cả Hà Nội, Thành phố Hồ Chí Minh và Đà Nẵng.
- Có tương đối đủ trang thiết bị nghiên cứu thí nghiệm và thử nghiệm hiện đại trong phòng thí nghiệm cũng như ở hiện trường, phục vụ nghiên cứu, đánh giá vật liệu, kết cấu công trình và chất lượng khai thác công trình, phương tiện giao thông vận tải. Viện có các phòng Thí nghiệm đạt chuẩn quốc gia (LAS) và là 1 trong 17 cơ sở kiểm định chất lượng trên toàn quốc.
Với tổng số nhân lực khoảng 600 người, trong đó có 264 viên chức trong định biên, có khoảng 30 Tiến sĩ và 50 Thạc sĩ, Viện có một đội ngũ các nhà nghiên cứu đủ sức đảm đương các nhiệm vụ được giao.
Từ ngày 27/02/2004, Viện đã được cấp Giấy chứng nhận quản lý chất lượng ISO 9001:2000. 
 
Nội dung hoạt động chính của Viện : 
Nghiên cứu khoa học - phát triển công nghệ:
- Hàng năm Viện chủ trì nghiên cứu thành công nhiều đề tài cấp Nhà nước, cấp Bộ và cấp cơ sở;
- Trong mười năm qua, Viện đã thực hiện thành công 199 đề tài cấp nhà nước và cấp Bộ, hàng trăm đề tài cấp Viện và một số Dự án triển khai công nghệ. Nhiều kết quả nghiên cứu đã được ứng dụng đem lại hiệu quả to lớn.
 
Đào tạo:
Nhiều năm nay, với các lớp đào tạo liên tục được mở, Viện đã đào tạo hàng ngàn cán bộ thí nghiệm. Từ 1995, được Bộ Giao thông vận tải giao tổ chức các lớp bồi dưỡng kỹ sư Tư vấn giám sát chất lượng công trình, Viện đã mở gần 30 khóa học với khoảng 3000 học viên. Từ năm 1990, Viện đã được công nhận là một trong các cơ sở đào tạo Tiến sĩ cho ba chuyên ngành: Cầu-Hầm, Đường bộ và Cơ học xây dựng.
 
Tình hình hoạt động triển khai, ứng dụng khoa học công nghệ: 
Kết quả triển khai các thành tựu khoa học công nghệ của Viện ngày một nâng cao. Trung bình, Viện ký khoảng 250-300 hợp đồng các loại với doanh thu khoảng 50 tỷ đồng mỗi năm. Nhờ đó Viện đã đóng góp vào ngân sách nhiều tỷ đồng và phát triển tiềm lực nghiên cứu của mình. 

Viện đã được tặng Huân chương Độc lập hạng hai, hạng Ba và nhiều Huân chương, Huy chương các loại. Viện đã làm tốt công tác tham mưu về Khoa học - Công nghệ và phục vụ công tác quản lý nhà nước của Bộ.